Disponemos de cuatro colecciones
El BG URJC cuenta con dos colecciones representativas de dos de los ecosistemas más característicos del centro peninsular (Alta Montaña y Semiárida), de una pequeña colección del género Lupinus, y de otra compuesta por semillas procedentes del archipiélago canario (Canarias).
La mayoría de las accesiones y especies conservadas en el BG URJC pertenecen a la colección de Alta Montaña. El BG URJC conserva semillas procedentes de 9 provincias españolas: Ávila, Cuenca, Guadalajara, Madrid, Salamanca, Segovia, Tenerife, Valencia y Zaragoza, aunque el 84% de las accesiones provienen de Madrid y Segovia.